如果你的目标只是发现这两个蛋白质的交联位点，则不用添加整个人库。库太大会使得鉴定
灵敏度下降。人库超级大，搜索速度也会很慢。

但也不能只添加两个蛋白质序列，因为蛋白质谱鉴定依靠target-decoy的FDR（假发现率）控
制策略。最好fasta中有上百个蛋白。你可以在添加数据库时，勾选“Add contaminant”添
加污染库。软件会自动给fasta追加百余个污染库蛋白。

（这个问题之前已邮件回复与您）

在寻找两个人源蛋白的交联位点时，fasta文件里可以只有这两个蛋白的序列吗？需要把整个
人的库加进去吗？谢谢！