Message417

Author pzmao
Recipients liudan2024, pzmao
Date 2024-04-08.06:57:59
Content
如果你的目标只是发现这两个蛋白质的交联位点,则不用添加整个人库。库太大会使得鉴定
灵敏度下降。人库超级大,搜索速度也会很慢。

但也不能只添加两个蛋白质序列,因为蛋白质谱鉴定依靠target-decoy的FDR(假发现率)控
制策略。最好fasta中有上百个蛋白。你可以在添加数据库时,勾选“Add contaminant”添
加污染库。软件会自动给fasta追加百余个污染库蛋白。

(这个问题之前已邮件回复与您)
History
Date User Action Args
2024-04-08 06:58:00pzmaosetmessageid: <1712530679.4819431.LFMB7723TS2P3PK2.issue164@pfind.org>
2024-04-08 06:58:00pzmaosetrecipients: + pzmao, liudan2024
2024-04-08 06:58:00pzmaolinkissue164 messages
2024-04-08 06:58:00pzmaocreate